BrainRing — 交互式脑连接环形可视化ツール

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BrainRing — 交互式脑连接环形可视化ツール

BrainRing — 交互式脑连接环形可视化ツール

ブラウザだけで動作するインタラクティブな脳接続（コネクティビティ）可視化ツール。Chord Diagram（環形弦図）を用いて脳領域間の接続強度を直感的に表示し、Brainnetome、AAL、Schaefer、Power264など8種類の脳図譜に対応。インストール不要でGitHub Pagesからデモを実行でき、MITライセンスの下で配布されています。（約300字）

https://github.com/XiuFan719/brain-connectivity-viz

概要

BrainRingは「交互式脑连接环形可视化工具（Interactive Brain Connectivity Chord Diagram Visualizer）」という、ブラウザのみで動かす脳ネットワーク可視化ツールです。インストールやサーバー、Pythonなどのバックエンド不要で、ローカルファイルを開くだけで行列データから脳領域間の接続を環状の弦図（Chord Diagram）として描画します。複数の標準脳図譜（Brainnetome、AAL、Schaefer、Power264など計8種）をサポートしており、探索的解析や可視化のプロトタイピングに適しています。GitHub Pagesでデモが公開されており、MITライセンスで配布されています。（約300字）

GitHub

リポジトリの統計情報

  • スター数: 7
  • フォーク数: 0
  • ウォッチャー数: 7
  • コミット数: 2
  • ファイル数: 3
  • メインの言語: HTML

主な特徴

  • ブラウザだけで動作：インストール不要、バックエンド不要、オフラインでも利用可能。
  • 複数の脳図譜対応：Brainnetome/AAL/Schaefer/Power264 等、合計8セットのアトラスをサポート。
  • インタラクティブなChord Diagram：領域間接続を直感的に探索（ホバーやクリックで情報表示が可能）。
  • GitHub Pagesでデモ公開、MITライセンスで配布。

技術的なポイント

BrainRingは軽量なフロントエンド実装で、脳接続行列を環状の弦図（Chord Diagram）へ変換して可視化する点が中核です。一般的にこうしたツールは、入力として隣接行列（CSVやJSON）を受け取り、脳領域のリスト（アトラス）に基づいて行列の行列和や強度を計算し、それを円周上の弧長や色で表現します。実装はHTMLベースで、SVGやCanvasを用いた描画（多くの場合D3.jsのChordレイアウトを利用）で弧とリボン（chords）を描き、色付けや透明度で接続強度を表現します。
インタラクティブ性は重要で、特定の領域にマウスホバーすると関連するリボンを強調表示、クリックで接続の詳細数値や領域名を表示するといったUIが想定されます。ユーザーが閾値やスケーリングを変更して表示をフィルタリングできると、密な行列でも視認性を保てます。
また、複数アトラスをサポートするために領域名とインデックスのマッピング、左右半球やネットワーク分類の色分けなどが含まれます。クライアントサイド完結の利点として、File APIを使ったローカルファイル読み込みや、URLパラメータによる設定の共有、画像エクスポート（SVG→PNG）などの機能も実装しやすい構成です。
パフォーマンス面ではノード数や接続数が増えるとレンダリングコストが増大するため、不要なリボンを描かない閾値処理、Canvas描画への切替、requestAnimationFrameによる描画分割などの工夫が有効です。さらに、大規模データでは逐次的に集計（行列の疎化・しきい値適用）してから描画することがレスポンス改善に寄与します。BrainRingは「No install, No backend」という設計方針から、こうしたフロントエンド中心の最適化やユーザーフレンドリーなファイル入出力機能を重視していると考えられます。（約700字）

プロジェクトの構成

主要なファイルとディレクトリ：

  • LICENSE: file
  • README.md: file
  • index.html: file

まとめ

シンプルで手早く脳コネクティビティを可視化できるブラウザツール。解析プロトタイピングに便利です。（約50字）

リポジトリ情報：