Senaite マルチウェルプレート管理アドオン

Tool

概要

Senaite.multiwellplate は、ラボで多用されるマルチウェルプレート(multiwell plate)のレイアウト設計からピペッティング計画の出力までをサポートする Senaite 向けアドオンです。プレートテンプレートに対してピペッティングルールやサンプル割り当てのルールを柔軟に定義し、サンプルや試薬を正しいウェルに配置するための支援機能を提供します。生成したピペッティングプランは印刷や出力に対応して、実作業のガイドとして利用可能です。リポジトリ自体は小規模で JavaScript を主要言語とし、Senaite に組み込む形で運用されることを想定した構成になっています。

GitHub

リポジトリの統計情報

  • スター数: 2
  • フォーク数: 0
  • ウォッチャー数: 2
  • コミット数: 2
  • ファイル数: 13
  • メインの言語: JavaScript

主な特徴

  • プレートテンプレートの定義と保存(ウェル数・フォーマットの管理)
  • カスタムピペッティングルールとサンプル割り当てルールの適用
  • サンプル・試薬の自動配置とピペッティングプランの生成・印刷
  • Senaite(LIMS)に統合して日常ワークフローに組み込める設計

技術的なポイント

このリポジトリは Senaite 向けの軽量アドオンとして設計されており、コード規模が小さいため導入やカスタマイズが比較的容易です。主要言語が JavaScript であることから、クライアントサイドでの UI 操作やテンプレート処理、出力フォーマット生成に JavaScript を利用していると推測されます。MANIFEST.in や LICENSE が含まれているため、パッケージングと配布を意識した構成で、静的アセット(ロゴやスタティックファイル)も同梱されています。

機能面では「テンプレート → ルール定義 → 配置 → ピペッティングプランの出力」というワークフローを備え、ルールベースの配置ロジックを持つことで複雑な配列条件(例えば希釈系列、コントロールの分散配置、複数サンプルの重複回避など)に対応できる設計が期待されます。出力は印刷用フォーマットやテーブル形式でのエクスポートを想定しており、実験者がプレート上での作業をそのまま実行できる形式に変換する役割を果たします。

Senaite のような LIMS と統合するためには、プラグインは通常、Senaite のコンテンツモデルやワークフローにフックする実装を持ちます。本リポジトリはその一部機能を JavaScript 側で実現しているため、バックエンド(Plone/Zope 等)との連携点は別リポジトリや上位レイヤーで補完される可能性があります。コミット数が少なくファイル数も限定的なことから、現状はプロトタイプまたは限定的な機能セットの実装段階であり、導入前に要件に合わせた拡張やテストが必要です。

拡張ポイントとしては、プレートフォーマットの追加、ピペッティングロボット向けのフォーマット(CSV/JSON)エクスポート、ルールのGUIによる編集、各種インテグレーション(LIMSのAPI連携、バーコード対応)などが考えられます。実運用に当たってはデータ検証、エラー検出(ウェルの重複や容量超過等)、ユーザー権限管理などの堅牢性確保も重要です。

プロジェクトの構成

主要なファイルとディレクトリ:

  • .gitignore: file
  • LICENSE: file
  • MANIFEST.in: file
  • README.md: file
  • README.rst: file

…他 8 ファイル

まとめ

Senaite 環境でマルチウェル操作を効率化する小規模なアドオン。導入前の検証と拡張が鍵。

リポジトリ情報:

READMEの抜粋:

senaite.multiwellplate

Plan. Place. Perform.

About

SENAITE.MULTIWELLPLATE is an add-on that provides a set of tools for labs that use multiwell plates in their daily routine analyses. It supports the full pipetting workflow: create plate templates with customizable pipetting and assignment rules, place samples and substances into the correct wells, print pipetting plans, and…